Muzeum Paleontologii w Neapolu jest najnowszym z czterech członków Centrum Nauk Przyrodniczych i Fizycznych Uniwersytetu Federico II.
Powstała w 1932 r., chociaż skamieniałe zbiory znajdowały się w Neapolitańskim Królewskim Muzeum Mineralogicznym jeszcze przed tą datą, w XIX wieku. Dziś znajduje się w klasztorze Świętych Marcellino i Festo.
Eksponuje kilka kolekcji: ryby kopalne z Giffoni Vallepiana, Pietraroia i Castellammare di Stabia, ssaki (jak czaszka młodego Elephas antiquus italicus), skamieniała palma, gady morskie i latające gady.
Od 1996 roku istnieje bardzo dobrze zachowany skamieniały okaz Allosaurus fragilis z Ameryki Północnej. Największa